Die berühmteste Vertonung stammt von Johann Sebastian Bach (BWV 245). Sie ist neben der monumentalen Matthäuspassion die einzige vollständig erhaltene authentische Bach-Passion. Ihre Uraufführung war am 7.04 1724 in der Nicolaikirche in Leipzig. Wie auch in der Matthäuspassion wird die Handlung aus vier verschiedenen Perspektiven vorgetragen:

• Erzählende Perspektive, ausgedrückt durch die Rezitative des Evangelisten und der handelnden Personen
• Betrachtende Perspektive, dargestellt in den zumeist lyrischen Arien
• Andachtsperspektive, in Form bekannter evangelischer Kirchenchoräle
• Ermahnende Perspektive, verkörpert durch die aufwändig angelegten Eingangs- und Schlusschöre

Die bachsche Johannespassion enthält ausgeprägte kontrapunktische Elemente, und greift auf zu dem Teil schon zu Bachs Zeiten altertümliche Instrumente wie die Laute, die Viola d'amore und die Gambe zurück.

Auch wenn mit der Johannespassion meist Bachs Werk gemeint ist, haben doch auch viele andere Komponisten die Leidensgeschichte Jesu nach Johannes vertont:

• Arvo Pärt (*1935)
• Lothar Graap (*1933)
• Georg Friedrich Händel (1685 -1759)
• Alessandro Scarlatti (1660 - 1725)
• Heinrich Schütz (1585 - 1672)
• Christoph Demantius (1567 - 1643)
• Leonhard Lechner (um 1553 - 1606)
• Joachim a Burck (1546 - 1610)